Асоциация на два полиморфизма в и в близост до гена socs3 със затлъстяване в три националности в

асоциация

  • Обобщение
  • Цел:
  • Методи:
  • Резултати:
  • Завършеност:
  • Въведение
  • материали и методи
  • Субекти
  • ДНК подготовка
  • Избор на полиморфизъм и генотипизиране
  • статистически анализ
  • Резултати
  • Характеристики на пробата
  • Честоти на генотипиране и алели
  • Асоциация на гените SOCS3 с количествени черти, свързани със затлъстяването.
  • Общ анализ
  • Стратифициран анализ на националността.
  • Линеен регресионен анализ.
  • Дискусия
  • Принос на автора

Обобщение

Цел:

Генът SOCS3 играе важна роля в патогенезата на затлъстяването при животински модели, но данните от проучвания при хора са относително ограничени. За да се реши този проблем, беше извършен анализ на генетична асоциация на националности с различен генетичен произход, живеещи в подобни условия на околната среда.

Методи:

Две хиляди седемстотин единадесет субекти бяха наети на случаен принцип от казахската, уйгурската и ханската националност в Синцзян, Китай. SNP полиморфизмите rs4969168 и rs9892622 в рамките на или близо до гена SOCS3 са генотипирани с помощта на анализа TaqMan-MGB ™. Проведено е проучване за асоциация между двата полиморфизма и свързаните със затлъстяването черти (индекс на телесна маса [ИТМ]; съотношение талия-ханш [WHR]; измервания на тегло, височина, талия и ханш).

Резултати:

Установена е значителна връзка между rs4969168 и свързаните със затлъстяването черти, включително ИТМ (25,32 ± 3,49 kg/m 2 за AA, 24,60 ± 3,70 kg/m 2 за AG, 24,39 ± 3,42 kg/m 2 за GG, P = 0,042), тегло (65,58 ± 11,42 kg за AA, 63,50 ± 11,30 kg за AG, 62,00 ± 10,78 kg за GG, P = 0,011) в ханска националност, но не и в казахстанска или уйгурска националност. Rs9892622 е значително свързан с ИТМ, WHR и WAIST при мъже от Уйгур. Rs9892622 също се свързва с ИТМ при казахстански мъже. Линейният регресионен анализ потвърди горните констатации. Нито един от двата полиморфизма обаче не е свързан със свързани със затлъстяването черти в общата популация.

Завършеност:

Полиморфизмът rs4969168 в или близо до гена SOCS3 има значителен ефект върху националността на Хан, докато rs9892622 е свързан със затлъстяването при уйгурски и казахски националности в Синцзян на Китай.

Въведение

Затлъстяването е основен проблем на общественото здраве в световен мащаб, засягащ хората от всички възрастови групи и етнически групи 1. Според Световната здравна организация (СЗО) в света има до 1 милиард хора с наднормено тегло, от които 300 милиона биха били класифицирани като клинично затлъстели (www.who.int). Освен това ситуацията в повечето развити страни е по-сериозна. Затлъстяването е основен рисков фактор за много здравословни проблеми, включително сърдечни заболявания, диабет тип 2 и повечето видове рак. Освен това тя представлява до 7,8% от общите разходи за медицински грижи в развитите страни 3. Многобройни проучвания се опитват да илюстрират патогенезата на затлъстяването.

Този доклад се фокусира върху връзката между гена SOCS3 и свързаните със затлъстяването черти в националностите Казак, Уйгур и Хан от провинция Синдзян в Китай. Избрани са два полиморфизма на SNP въз основа на данните за полиморфизма на маркера на проекта HapMap и предишни G проучвания на SOCS3 и захарен диабет тип 2: мета-анализ на четири независими популации от проучването. PLoS One 2008; 3: e3852. "Href =/articles/aps201184 # ref11 aria-label =" Reference 11 "data-track = click data-track-label = link> 11, 12. Полиморфизмът е A + 930 → G (rs4969168) полиморфизъм, който се намира в 3'UTR на гена SOCS3, който е SNP (htSNP), който в достатъчна степен маркира хаплотипа и покрива в достатъчна степен генетичната вариация на целия ген. Другият SNP, избран за това изследване, е rs9892622 A → G, вариант на честота, близка към гена, който е в промоторния регион нагоре от гена SOCS3 и изглежда разумен функционален кандидат за локуса и затлъстяването на SOCS3.

материали и методи

Субекти

Субектите (n = 2711) са наети от три раси от Синцзян в Китай. Всички субекти са преминали нормалния медицински преглед и са били подбрани на случаен принцип, включително 1045 казахи, 804 уйгури и 862 ханци на възраст от 19 до 87 години. Местната комисия по етика одобри проучването и всички участници дадоха своето информирано съгласие. Височината на стойката (височината) се измерва (с точност до 0,01 m) със стадиометър. Измерва се телесно тегло (тегло) (с точност до 0,01 kg) с претегляща машина. Индексът на телесна маса (ИТМ) се изчислява като тегло в килограми, разделено на квадратен ръст в метри. И накрая, обиколката на талията (WAIST), обиколката на тазобедрената става (HIP) и съотношението талия-ханш (WHR) бяха определени, както е описано по-рано 13 .