Микробиота и регулиране на възпалението с диета Регенерира
L да се чревна микробиота се състои от комплекс екосистема от бактерии, гъбички и вируси (3. 4). Изследванията отдавна са фокусирани върху бактериите, но все повече и повече гъбичен и вирусен микробиом придобиват значение. Гъбичният микробиом (микобиом) е неразделна част от стомашно-чревна екосистема с до 10 милиона микроорганизми на грам изпражнения. Преди това гъбите са били разглеждани като патогенни микроби и ролята му за хранене беше пренебрегната. Сега е ясно, че коменсалната гъбична микробиота е важна част от човешката стомашно-чревна екосистема.
Смята се, че видовете на преобладаващи коменсални гъби те са Candida spp., Saccharomyces cerevisiae и Malassezia spp.; докато Aspergillus spp., Mucor spp., Cryptococcus spp., Rhodotorula spp., Trichosporon spp., Histoplasma spp., Coccidiodes spp., Paracoccidioides spp. са класифицирани като патогенни. и Blastomyces spp (35).
Многобройни взаимодействия между гъбички и бактерии и неговия комплекс стомашно-чревен имунен отговор са свързани с патофизиологията на възпалително заболяване на червата и други стомашно-чревни възпалителни образувания като пептични язви (36). The микотоксини генерирани като гъбични метаболити допринасят за нарушения на имунната система и промени в стомашно-чревната бариера и са свързани с cхронични възпалителни състояния на червата, вторични гъбични инфекции, хепатоцелуларен рак Y. езофагогастрален рак (37).
Техниките за секвениране от ново поколение позволяват достъп до важни знания за вирусната част на микробиома (Virom)
В проучване с затлъстели пациенти, е установена връзка с различни гъбички. Mucor racemosus и Mucor fuscus са най-представените видове при лица със затлъстяване в сравнение с техните затлъстели колеги. Интересното е, че намаляването на относителното изобилие на рода Mucor при затлъстели лица е обратимо в случай на отслабване (38).
От друга страна, благодарение на пристигането на техники за секвениране ново поколение има достъп до важни знания за вирусната част на микробиома (Virom). Тази вирусна екосистема кодира голям репертоар от функции, вариращи от бактериална вирулентност до поддръжката на стабилност на екосистемата гостоприемник-микробиом (39). Тази човешка чревна вирома се определя като общата популация от вируси (или вирусоподобни частици), свързани с по-рано наречената микробиота. Състои се от РНК и ДНК, еукариотни вируси и бактериофаги (40). Всъщност, Ентерична вирома е в динамично равновесие с други елементи на микробиом и от чревна имунна система, играеща ключова роля за здравето и болестта на приемника (41). Например, натоварването с Anellovirus (еукариотна ДНК вирус) е пряко свързано с имуносупресията (40).