Ползите от чревната микробиота от проби; ticos, prebi; тикос и симби; тикос в нормалното си
Тъканите, които изграждат органите и вътрешните системи на човешкото тяло, обикновено не съдържат микроорганизми при здрав индивид. Въпреки това тъканите на телесната повърхност, като кожата и лигавиците на дихателните, стомашно-чревните, очните, пикочните и репродуктивните пътища, които са постоянно в контакт с външната страна и следователно с организмите в околната среда, бързо се колонизират от различни видове микробни клетки, които се превръщат в нормална човешка микробиота. Човекът е колонизиран от нормалната микробиота по време на раждането и преминаването през родовия канал. Първоначалният контакт с околната среда, с други хора и храненето на бебето след раждането води до развитието на стабилна нормална микробиота в кожата, устната кухина и чревния тракт за приблизително 48 часа. Установяването на „здравословна“ връзка в началото на живота изглежда критично за поддържането на чревната хомеостаза.
Колективният генетичен състав на хиляди видове микроорганизми, които съставляват нормалната микробиота при хората, е известен като човешки микробиом
Понастоящем е известно, че обширен микробиом, съставен от бактерии, вируси, бактериофаги и гъби, се запазва на почти всяко място в човешкото тяло. Геномите на тези микроби непрекъснато взаимодействат с човешкия геном, за да регулират метаболизма на гостоприемника. Много от компонентите на този микробиом са способни както на коменсална, така и на патогенна активност. Те също така са способни да продължат както в остра, така и в хронична форма на заболяването.
По-голямата част от активността на нормалната микробиота е от полза за госта, и най-често срещаната връзка, установена между здравия индивид и обитаващата го нормална микробиота, е известна като коменсализъм. Следователно голяма част от нормалната микробиота се състои от коменсални бактерии. Болестите, които се произвеждат от нормалната микробиота в техния гостоприемник, често се наричат опортюнистични, което означава, че потенциално патогенните бактерии трябва да получат специална възможност на слабата имунна система гостоприемник да зарази.
Докато това, което представлява „здрава“ микробиота на дебелото черво, все още е известно само частично, много скорошни проучвания установяват кои бактериални видове са свързани със здрава микробиота. От друга страна, все по-очевидно е, че има набор от малки молекули, произведени в микробиотата, които имитират или действат като невротрансмитери. Тези открития, заедно с факта, че интервенциите с пробиотици могат да променят емоционалното и психологическото състояние на индивидите, както при модели на хора, така и при животни, предполагат, че съпътстващите заболявания на централната нервна система, често свързани със стомашно-чревни заболявания, могат да произхождат от червата, както и в резултат на микробни дисбиоза. Изследванията на популацията на микробиома постепенно хвърлят светлина върху механизмите, които обясняват тази дисбиоза. На свой ред дисбалансът или дисбиозата на микробните екосистеми направиха възможно свързването на възпалителни състояния, изучавани исторически поотделно (автоимунни, неврологични и злокачествени). Известно е, че колективната активност на микробиома задвижва възпалителните процеси чрез сложни взаимодействия между микроби и микроби и гостоприемници.