Антибиотици и микробиом при аутизъм; Кортикален шовинизъм
Антибиотиците се използват от стотици години за лечение на инфекции. Всъщност преди около две хиляди години египтяни прилагали плесенясал хляб за лечение на заразени рани. Активната съставка в плесенясалия хляб обаче, полезна за борба с инфекциите, е открита едва през 1928 г. от Александър Флеминг. От този момент нататък минаха около 14 години преди масовото производство на пеницилин. Наличният в търговската мрежа пеницилин първоначално е тестван в група жертви на изгаряния, които са получили кожни присадки. Лечението се оказа чудотворно, помагайки на пациентите да се възстановят от това, което би било много болезнена смърт. Малко след това армията приема използването му за своите войски (1943). През Втората световна война нуждата от пеницилин беше толкова голяма, че през тези години военните използваха 85% от доставките на страната.

В допълнение към лечението на бактериални инфекции, антибиотиците имат и някои неочаквани ползи за здравето. Те се използват в химиотерапията, тъй като позволяват на лекарите да бъдат по-агресивни, като предизвикват имуносупресия при пациенти с рак. Те също се използват рутинно при трансплантации и като превантивно лечение за хирургични процедури. За съжаление, не след дълго след въвеждането на антибиотиците, бактериите започнаха да развиват резистентност срещу тях. Масовото предписване означава, че в много случаи те са били прилагани неправилно; като се използва неправилна доза и/или продължителност. Освен това, при употребата на антибиотици е налице обратна връзка с прототипични инфекциозни заболявания и пряка връзка с имунни нарушения (напр. Диабет и астма). Трябва да се отбележи, че тази корелация между употребата на антибиотици и имунните нарушения не предполага причинно-следствена връзка. Затлъстяването, рисков фактор, водещ до диабет, също се е увеличило през периода на повишена употреба на антибиотици.
Понастоящем може да са необходими някои полезни обяснения. Терминът микробиом се отнася до съвкупността от микроорганизми, които се намират в повърхностните и дълбоки слоеве на кожата, устната лигавица, конюнктивата и стомашно-чревния тракт. Вътре в човешкото тяло има 10 пъти повече микробни клетки от човешките клетки; включително бактерии, гъбички и вируси. Тази връзка се оказа взаимноизгодна. Домакинът осигурява стабилна среда, температура и хранителни вещества на своята микробиота. В замяна микробите ни осигуряват витамини и микроелементи като ретинол, рибофлавин, фолиева киселина, биотин и ниацин. Микробиотата също намалява нашата чувствителност към определени патогени и влияе върху метаболизма на лекарствата (Swanson, 2015).
Друг полезен термин за разбиране е метаболомиката. Терминът се отнася до характеризиране въз основа на аналитични методи на метаболити, генерирани от един или повече организми в даден физиологичен и екологичен контекст. Метаболомиката дава възможност за по-добро разбиране на динамичните операции на микробните общности.